Однажды демон напал на деревню, в которой родился мальчик Наруто. Чтобы остановить демона, глава поселения запечатал его внутри Наруто, но сам при этом погиб. Прошли годы. Наруто вырос, став гиперактивным и очень тупым ниндзя. Он всё ещё живёт в родной деревне, где его не особо любят и стараются избегать.

Был освобождён древний демон, и если его не запечатать обратно, он разрушит мир. Демон посылает своих приспешников, чтобы убить единственного человека, который способен его запечатать. Но до этого в Конохе узнают о демоне и высылают Наруто, Сакуру, Ли и Неджи, чтобы защитить Шион - монашку, которая может запечатать демона. Еще она может видеть будущие смерти людей, который находятся рядом с ней. Когда Наруто спасает её от демонских приспешников, она видет, что Наруто должен скоро умереть. Как же он воспримет этот факт?

Наруто , Какаши , Сакура и Рок Ли получили задание: защитить принца Мичиру и его сына Хикару во время кругосветного путешествия и проследить, чтобы они спокойно, без каких-либо потерь, вернулись домой, в Лунную Страну. На самом деле Лунная Страна очень и очень богата, посему принц без разбору покупает все, что пожелает его сердце. Однажды, компания случайно попадает на представление цирковой труппы, где гвоздь программы — роскошный и необычайно редкий саблезубый тигр, которого Хикару непременно вознамерился заполучить. Дабы долго не мучиться, Мичиру решил купить всю труппу. Внезапно миссия по защите избалованного мальчишки, который едва слушает, что ему говорят, превращается в миссию по присмотру за всеми животными и за тем же неугомонным капризным Хикару. И, разумеется, венцом сей неприятной ситуации является доставка в целости и сохранности всей этой оравы на родину принца — в Лунную Страну. Да еще и, как назло, появляются три таинственных ниндзя, обладающие какими-то пугающими дзюцу. Почему они атакуют их? Что им надо от «Команды ]»?!

В Пяти странах никогда не переводятся персонажи, желающие возвыситься и достичь абсолютной власти за счет других. На дворе очередной кризис - синоби с Кровным даром начали пропадать из скрытых деревень Травы, Камня, Облака и Песка. Не тронута только деревня Листвы, что вызывает резонные подозрения у остальных четырех наций. Впрочем, разведка Конохи быстро вычислила, что следы пропавших ведут на гору Сумисэн. Вот только после отчаянной и неудачной попытки добыть информацию, в небе над деревней Листвы явилась гигантская фигура, возвестившая начало новой Великой войны ниндзя. Коноха в беде. Соседи не слушают доводов разума и стягивают войска, а князь Страны Огня приказывает Цунадэ быстрее найти истинного виновника или приготовиться к уничтожению. Собрав воедино все имеющиеся сведения, Хатакэ Какаси решает пожертвовать собой ради существования деревни. Лучшие стратеги Листвы и Песка не смогли найти иного плана, и, хоть с тяжким сердцем, но одобрили его выбор. Но что значит холодная логика против одного-единственного ученика Какаси-сэнсэя, парня в оранжевом, который не приемлет принцип «меньшего зла»? Ведь в мире Наруто побеждают те, кто голосует сердцем!

В деревне Скрытого Листа каждый день бесстрашные ниндзя выполняют миссии и учатся, оттачивая боевые навыки. Один из них — синоби Рок Ли, который не может использовать ниндзюцу. Он тренируется не покладая рук вместе с товарищами, Тэн-Тэном и Нэдзи Хьюгой, под руководством требовательного наставника Майто Гайи.

Будущее. Поездам больше не нужны рельсы, ведь теперь они поднимаются в небо и курсируют по галактическим железным дорогам, осуществляя перевозку людей с планеты на планету. Однако преступники, террористы и пришельцы совершают нападения на поезда. Манабу Юки — боец элитных сил космической обороны, который любой ценой должен защитить пассажиров.

Наруто решает принять участие в состязаниях ниндзя, в которых новички получают шанс схлестнуться со своими наставниками. Пытаясь сосредоточиться, Наруто становится одержим противостоянием с Какаси Хатакэ.